新たなBLAST解析により偽陽性の懸念が高まる
既報のハンタウイルスRT-qPCRアッセイで使用されたフォワードプライマー、リバースプライマー、および蛍光プローブについてBLAST解析を行ったところ、ヒトのゲノム配列と完全に一致する部分が繰り返し確認されました。これにより、特定のアッセイ条件下において、ヒトの核酸がハンタウイルスPCRの陽性シグナル生成に寄与している可能性があるのではないかという疑問が生じました。
BLASTとは「Basic Local Alignment Search Tool」の略で、生物学的配列を比較するために広く用いられているバイオインフォマティクスアルゴリズムです。
平たく言えば、ハンタウイルスを検出する目的でPCR検査に使用される遺伝子配列の一部は、ヒトのDNA配列とも直接一致しています。
つまり、検査の構成要素は、配列レベルにおいてハンタウイルスにのみ特有のものではなかったということです。
陽性の結果は、ウイルスではなく、ヒト由来の物質が存在していることを示している可能性があります。
この事実が明らかになったのは、西アフリカ沖のクルーズ船でハンタウイルスの集団感染が疑われているとして、主流メディアが警鐘を鳴らしている最中のことです。https://apnews.com/live/hantavirus-cruise-ship-updates-05-06-2026
この新たなBLASTの知見は、米国特許 5,210,015と併せて検討すると、その重要性がさらに高まります。同特許では、PCRプローブの補完性は「完全である必要はない」こと、また「ポリメラーゼ非依存的な切断」を通じて検出可能なシグナルが生じ得ることが明示されており、これは、検出可能な蛍光シグナルの発生に、必ずしも標的配列の完全な増幅が必要ではないことを意味しています。
より簡潔に言えば、現代のTaqMan PCR検査の基礎となっているこの原特許は、遺伝子の適合性が不完全な場合や、標的配列の完全な増幅が行われていない場合でも、この化学反応によって検出可能なシグナルが生成され得ることを認めているのです。
ハンタウイルスPCRの構成要素とヒトの遺伝子との間に部分的な類似性があるだけで、たとえウイルスが存在しなくても、検査結果が陽性となる可能性があります。
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